1868年，第十三代藩主泰在卯辰山，庚申冢的土中出日月天子像，将其托付日教上人祭祀，本寺以此起源。1879年京的善妙院移并改号立向山善妙寺。寺内安放与文豪泉花有因的摩耶夫人尊天像。